1. 按 TRIzol 的使用手冊(cè)進(jìn)行總 RNA 提取到加氯仿之前一步。
2. 如果需要加氯仿,則繼續(xù)按TRIzol的使用手冊(cè)操作,用氯仿處理裂解液離心后得到上清液。如果省略氯仿處理步驟,則需要將裂解物直接離心。
3. 將經(jīng)過氯仿處理得到的上清液或沒有經(jīng)過氯仿處理直接離心得到的裂解液轉(zhuǎn)移至一個(gè)干凈的 1.5 mL 塑料離心管中。注意:如果是經(jīng)過氯仿處理,則離心后,下層有機(jī)相和中間層將含有DNA和蛋白質(zhì),避免觸及,否則將產(chǎn)生蛋白質(zhì)和 DNA 污染。為保險(xiǎn)起見,可以留下100 μL上清液不取。同時(shí)吸取上清時(shí)*好緩慢進(jìn)行,否則容易吸出交界面的不可見的絲狀DNA。
4. 加入等體積的柱式動(dòng)物RNAout溶液B,顛倒混勻 30 秒。
5. 根據(jù)混合物的多少,一次或分兩次轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中。
6. 每次轉(zhuǎn)移后,需要13000-15000 g室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。
7. 加0.7 mL通用洗柱液到離心吸附柱中,室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。一次洗滌一般足夠去除雜質(zhì)。但如果樣品OD260/280比值不高,可以再用0.3 mL通用洗柱液重復(fù)此步一次。
8. 室溫離心半分鐘。此步對(duì)去除殘留通用洗柱液十分重要,否則殘留的通用洗柱液會(huì)影響RNA的質(zhì)量和使用。
9. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到一自備的RNase-free收集管中,加入50-100 μL RNA洗脫液。
10. 室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為RNA樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
11. RNA完整性的電泳檢測(cè):如果需要做Northern雜交,強(qiáng)烈建議用戶使用甲醛變性膠進(jìn)行RNA電泳,因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。
12. RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測(cè)定:將5-10 μL RNA溶于TE緩沖液中(pH 7.5-8.2 之間)檢測(cè)其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1 OD260的RNA=40 μg/mL),進(jìn)而計(jì)算出RNA的產(chǎn)量(濃度 X 體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。
13. RNA純度測(cè)定:無污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響RT-PCR等反應(yīng)。
|